Minicurso 1

Análise de Microarranjos Empregando Ferramentas do Projeto BioConductor

Benilton Carvalho (Johns Hopkins University)

O BioConductor, iniciado em 2001, é um projeto que disponibiliza gratuitamente ferramentas, principalmente estatísticas, para a análise de dados genômicos. Tais ferramentas consistem de pacotes para a aplicação R e, assim como o próprio R, possuem código aberto, oferecendo aos usuários flexibilidade e a possibilidade de extender métodos já existentes.

Microarranjos são dispositivos que permitem o estudo de unidades genômicas, variando de um gene a um único sítio em todo o genoma, geralmente comparando-as entre tratamentos ou grupos. Estes arranjos estão disponíveis para os mais diversos organismos e resultados podem ser observados em diversas áreas como, por exemplo, saúde (análise do perfil genético de pacientes de uma determinada doença e suas respostas a certos tratamentos) ou agropecuária (melhoramento de sementes e gado).

Este curso possui um teor introdutório e apresentará exemplos de estudos com microarranjos, empregando o ferramental disponibilizado pelo projeto BioConductor. A teoria biológica será apresentada de maneira simplificada, enquanto o foco estará em aplicações, como análise de expressão gênica e genotipagem, juntamente com as soluções estatísticas propostas na literatura. Aos participantes serão apresentados os desafios estatísticos e computacionais encontrados nesta área e espera-se que isto possa motivar futuras pesquisas e colaborações.